2022-04-06 12:22

分子生物学:测量基因的更好方法

Molecular biology: better method for measuring genes

LMU的科学家们已经开发出一种更有效地测量基因活动的方法,从而更好地理解生物过程。

所有细胞都有相同的基因,但就其不同的功能而言,重要的是哪些基因在何时、何地以及在何种程度上处于活跃状态。活性基因在细胞中被复制到信使RNA (mRNA)分子中,信使RNA分子是相应蛋白质的构建手册。在人类细胞的大约2万个基因中,哪一个以mRNA的形式存在因此,对于理解生物过程来说,这是非常有用的信息。

几年来,通过高通量测序,我们已经能够很好地测量出mRNA的全部范围,即转录组。高通量测序包括对一个样本的mRNA拷贝进行测序,然后对每个基因进行计数。这种“RNA-seq”已经成为分子生物学的关键工具之一。“高效的RNA-seq决定了我能分析多少样本,因此在给定的预算下我能获得多少生物信息,”LMU的生物学家Wolfgang Enard说,他和他的团队已经开发出可能是目前可用的最有效的RNA-seq方法。

研究人员已经将他们的方法命名为素数序列,并且已经成功地将其应用于LMU内外的30多份不同的出版物上。在他们最近发表在《基因组生物学》杂志上的一篇论文中,他们已经表明,质数测序和其他rna测序协议一样可以测量转录组,而且成本效益要高50倍。

该方法可以在任何分子生物学实验室中实现,而不需要昂贵的设备。它的效率主要是基于DNA条形码的整合和直接从细胞中提取mRNA。“在不断增长的研究领域中,稳健、有效、经济的方法正变得越来越重要。我们希望我们的方法也将为科学的更大的开放性和可重复性做出贡献,”该研究的主要作者之一Lu迪拜房产cas Wange说。